網站定制中的設計也是網站定制的關鍵點，設計網頁時首先要考慮的是網站的內容，一個網頁在設計時要明確內容，才能正確定位網站，確認網站的特定功能。明確內容后，整個設計應圍繞這方面進行，應根據用戶的具體需求設計網站。每個網站都應該有自己的主題顏色，確定主題顏色后，可以在此主題顏色周圍繪制輔助顏色和漸變色，以點綴網頁顏色，可以讓用戶更好地識別這個網站，用戶訪問網頁時不能忍受的是在網頁打開時加載頁面。
現在的網站已經不喜歡設計得太過復雜了，越來越扁平化、簡潔化，這主要是從符合用戶喜好的方向出發的，簡潔設計的網站，能夠給人賞心悅目的視覺享受，在找資料的時候也更加的方便。一個簡潔設計網站內容的多樣性，主要表現在用戶能否找到正確的信息，能否找到正確的答案，能否找到自己想要的資源，用戶想要的，我們這里都能滿足，還包括交互性需求、問答型需求、顯性需求和隱式需求。

在進行網站定制設計的時候，一定要注重顏色搭配問題，盡可能將顏色控制在三種顏色之內，并且將企業的主色調進行突出，注重整體風格的搭配。注重網站的首頁內容，盡可能將首頁內容表現的突出，由于首頁內容的質量好壞直接影響到用戶的瀏覽體驗，在國內的很多企業在進行首頁內容展示的時候，為了盡可能的使首頁內容更加的豐富，都會選用一些主頁模塊。